Staden Package Пакет Staden — это идеальный инструмент для быстрого и простого сбора геномных данных. Анализируйте свои последовательности с помощью самого мощного программного обеспечения, которое у вас есть (например, Seqman, Phrap, Consed, BLAST, Tandem Repeats Finder, RepeatMasker и т. д.). Преобразуйте последовательности в RCD (программное обеспечение для преобразования уже включено в этот пакет) и отредактируйте их с помощью Блокнота и/или другого формата по вашему выбору. Объединяйте свои последовательности с FASTA или одним из многих форматов редактирования для легкой печати. Вы также можете создать свой собственный формат для своей последовательности. База данных предоставляет следующую информацию: Рекомендации по отправке Это место, где будут отправлены ваши данные (электронные письма, файлы и т. д.). После входа в систему вы найдете инструкции по процессу отправки последовательности. Основные возможности электронного инструмента Это инструмент, используемый учеными для представления своих данных и анализа результатов. Это позволяет вам отправлять и редактировать свою последовательность удобным способом. Кроме того, вы можете работать с двумя сборками последовательностей (Gap4 и Gap5). Когда вы отправляете последовательность из Gap5, она будет автоматически преобразована в формат Gap4. Инструменты и программное обеспечение доступны на экране, позволяя вам делать следующее: В левой рамке: - Выберите данные (электронные письма, файлы и т. д.), которые вы хотите отправить в базы данных (которых может быть несколько). - Выберите, какой формат ввода вам наиболее удобен (FASTA, TAB, EMBL или RCD). - Напишите информацию о последовательностях (например, «тип последовательности» и «цель» вашей последовательности). В правом верхнем кадре: - Значок позволяет начать процесс сборки (сборка и просмотр последовательности, анализы и т. д.). - Вы можете отправить несколько последовательностей одним щелчком мыши. - Отображается количество последовательностей и нуклеотидов, а также время выполнения. - В правом нижнем кадре: - Этот кадр используется для отправки ваших данных в базу данных сразу. - Из этого фрейма вы можете выбрать отправку данных по электронной почте или непосредственно в файл. - Если вы решите отправить данные, укажите свой собственный адрес (который будет использоваться для отправки ваших данных). - При отправке данных в файл у вас есть возможность выбрать расположение файла, куда вы хотите отправить свою последовательность в левом нижнем фрейме. - • Сборка и редактирование с помощью быстродействующего редактора Visual Sequence Editor. • Качественное редактирование последовательностей • Поддерживаются файлы Gap4 и Gap5. • Поддерживается файл последовательности — FASTA, FASTQ, FASTQG, MS/MS, BAM, WIG, SOAP и многое другое. • Совместимость с высокоскоростным или низкоскоростным интернет-соединением • Возможность работы со всеми платформами • Несколько инструментов платформы • Поддержка редактирования и сборки на всех платформах • Редактирование и сборка в режиме просмотра псевдо-HTML на таких платформах, как win32, Linux, MacOS X и других... • Поддерживает различные типы последовательностей — последовательности нуклеотидов (ДНК, РНК) и последовательности белков (белки, пептиды). • Подпроекты DnaSeq и Editseq • Стабильность редактора графических последовательностей • Поддержка R, C++, Java, Python и других интерфейсов прикладного программирования (API) • Полезно для начинающих и продвинутых пользователей FILED НЕ ДЛЯ ПУБЛИКАЦИИ 18 АПРЕЛЯ 2010 ГОДА МОЛЛИ К. ДУАЙЕР, Клерк АПЕЛЛЯЦИОННЫЙ СУД США Апелляционный суд США fb6ded4ff2
Related links: